Clinic Pilates, fizyoterapistler ve sağlık profesyonelleri tarafından yürütülen, özellikle rehabilitasyon ve sakatlanma önleme amacı taşıyan bir Pilates türüdür. Bu yöntem, özel ihtiyaçları olan bireyler için tasarlanmıştır ve genellikle medikal sorunları olan veya iyileşme sürecinde olan hastalara uygulanır.